Η διοίκηση του gi-Cluster πραγματοποιείται από επταμελές Διοικητικό Συμβούλιο, με αιρετά μέλη.
Στόχος της ομάδας διοίκησης του gi-Cluster είναι η απρόσκοπτη και παράλληλα, επιτυχημένη υλοποίηση του Επιχειρησιακού Σχεδίου (Business Plan) του cluster, προσφέροντας απτά οφέλη και ίσες ευκαιρίες ανάπτυξης σε όλα τα μέλη.
Το Διοικητικό Συμβούλιο στο οποίο συμμετέχει ένας εκπρόσωπος του Συντονιστή φορέα, πέντε επιχειρηματικά μέλη και ένας εκπρόσωπος των πανεπιστημιακών και ερευνητικών φορέων,
παρέχει τις στρατηγικές κατευθύνσεις και συμμετέχει στον σχεδιασμό και την υλοποίηση των στόχων του gi-Cluster,
παρακολουθεί και συμβάλλει στην άρτια εκτέλεση των συμφωνηθέντων δράσεων,
Το Διοικητικό Συμβούλιο έχει εκχωρήσει αρμοδιότητες γενικής διαχείρισης και συντονισμού στον gi-Cluster Manager.